منطقه آزاد ارس در 4 بخش منفصل در شمال غرب ايران و نقطه صفر مرزي در مجاورت با کشورهای ارمنستان، آذربايجان و جمهوري خودمختار نخجوان و کنار رود مرزی ارس قرار دارد.